Хгп: ХГП, ООО, ИНН 7810013748 | Реквизиты, юридический адрес, КПП, ОГРН, схема проезда, сайт, e-mail, телефон

Содержание

Роль в микробиоценозе в норме и при хроническом генерализованном пародонтите

Актуальность. Формирование бактериальных биопленок вносит существенный вклад в развитие хронического пародонтита и других болезней пародонта. Ведущая роль в механизме прогрессирования пародонтита, с позиций микробных экосистем, отводится пародонтопатогенам, в то же время малоизученным остается вопрос выявления роли представителей нормофлоры, рассматриваемой как критерий здорового пародонта.

Цель исследования — изучить влияние Veillonella parvula на состояние микробиоценоза пародонта в норме и при хроническом генерализованном пародонтите (ХГП).

Материал и методы. Исследование проводили на клинической базе кафедры ГБОУ ВПО «Первый МГМУ им. И.М. Сеченова». Основная группа включала 78 пациентов с диагнозом «ХГП», группа контроля — 75 пациентов без патологии пародонта (средний возраст — 42,6±11,3 года), из них 61 мужчина и 92 женщины. По данным клинического обследования состояния тканей пародонта и данным ортопантомографии устанавливали диагноз «ХГП». Для проведения микробиологического исследования проводился забор содержимого пародонтального кармана (зубодесневой бороздки) с помощью стерильных бумажных эндодонтических штифтов (размером № 25) в 2 повторностях. При помощи метода ПЦР в реальном времени осуществляли качественный и количественный анализ соотношения исследуемых бактерий во рту. Был использован набор реагентов Дентофлор (ООО «НПО ДНК-Технология», Россия)

, состоящий из специфичных праймеров и специфичного к последовательности продукта флюоресцентно-меченого зонда типа TaqMan к 5 пародонтопатогенным агентам A. actinomycetemcomitans, P. gingivalis, P. intermedia, T. forsythensis, T. denticola, и разработанный в рамках работы комплект для детекции V. parvula. В качестве гена-мишени для идентификации V. parvula и родственного ей, но не идентичного вида Veillonella spp., был выбран ген лактат-пермеазы. Участок ДНК выбранного гена из полногеномной последовательности коллекционного штамма
V. parvula
DSM 2008 был получен из базы данных NCBI GenBank, где он хранится под номером доступа Sequence: NC_013520.1. Интерпретация результатов проводилась с учетом такого параметра, как «пороговый уровень обсемененности», позволяющий отличить патологическую обсемененность пародонта (ассоциированную с развитием заболевания) от нормальной, встречающейся у лиц без поражения пародонта. Статистическую обработку данных проводили с помощью пакета Statistica 8.0 для Windows с использованием корреляционного анализа по методу Спирмана.

Результаты. По данным клинического осмотра и ортопантомограммам пациентов установлено, что 64,8% респондентов имели среднюю степень тяжести ХГП и 35,2% — тяжелую. Полученные данные свидетельствуют, что уровень обсемененности пародонта V. parvula в основной и контрольной группах существенно отличается. Количество кандидатного представителя нормофлоры у здоровых пациентов было существенно выше, чем в основной группе — суммарное значение основной группы составило 4908,5, а контрольной — 6872,5, что косвенно подтверждает протективную роль

V. parvula на пародонте. Гендерных отличий при количественной оценке обсемененности V. parvula не обнаружено. Проведенный анализ выявил неодинаковый характер взаимодействия V. parvula с основными пародонтопатогенами. Так, наиболее сильные обратные связи получены с пародонтопатогенами P. gingivalis — 0,25; T. forsythensis, P. intermedia — по 0,27. При оценке корреляционных зависимостей парных взаимодействий основных пародонтопатогенов и V. parvula установлено наличие статистически достоверных обратных корреляций V. parvula со всеми исследуемыми пародонтопатогенами, за исключением A. Actinomycetemcomitans.

Вывод. Высокая обсемененность пародонта представителями нормофлоры у пациентов без патологических изменений пародонта не только не свидетельствует о нарушениях, но и может рассматриваться, как критерий здоровья. Исследованный представитель микробиоценоза пародонта

V. parvula имеет строгую ассоциацию с отсутствием болезней пародонта и обратные связи с обсемененностью основными пародонтопатогенами.

Особенности антимикробного иммунитета полости рта у беременных женщин с хроническим генерализованным пародонтитом в течение гестационного периода Текст научной статьи по специальности «Клиническая медицина»

УДК 616.314.18-079:618.3.

ОСОБЕННОСТИ АНТИМИКРОБНОГО ИММУНИТЕТА ПОЛОСТИ РТА У БЕРЕМЕННЫХ ЖЕНЩИН С ХРОНИЧЕСКИМ ГЕНЕРАЛИЗОВАННЫМ ПАРОДОНТИТОМ В ТЕЧЕНИЕ ГЕСТАЦИОННОГО ПЕРИОДА

Сурменева1 С. О., Лапина2 Н.В., Чибичян1 Е.Х.

ФГБОУ ВО «Ростовский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения России, г.Ростов-на-Дону, Россия.

2ФГБОУ ВО «Кубанский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения России, г. Краснодар, Россия.

Аннотация. В статье в динамике беременности при хроническом генерализованном пародонтите (ХГП) средней степени тяжести изучено изменение концентрации антимикробного пептида кателицидина КЬ-37 в ротовой жидкости. У беременных женщин при ХГП средней степени тяжести в первые два триместра повышенное содержание кателицидина LL-37 в слюне способствует повышению антимикробных врожденных механизмов резистентности к патогенным бактериям с последующим снижением антимикробного фактора к 3 триместру гестацион-ного периода. Этот факт является обоснованием для поиска маркеров индукции антимикробных пептидов в целью сдерживания воспалительных изменений в пародонте и основанием для активизации профессиональных гигиенических мероприятий в ротовой полости при беременности.

Ключевые слова. беременность, хронический генерализованный пародонтит, ротовая жидкость, антимикробные пептиды, гестационный период

Бактерицидные свойства ротовой жидкости, обусловленные содержанием в ней большого количества антибактериальных протеинов — лизо-цима, лактоферрина, лактопероксидазы, иммуноглобулинов, агглютининов и муцинов, пептидов антимикробного действия (гистатинов, дефе-нзинов и кателицидина LL-37), обуспечивают мукозальный или врожденный иммунитет ротовой полости [1]. Особая роль в мукозальном иммунитете отводится противомикробным пептидам — катионным белкам, которые обладая широким спектром противомикробной активности, выполняют ряд важных функций как медиаторы воспаления, оказывают иммуномодулирующее и цитотоксическое действие, влияют на хемотаксис лейкоцитов и играют важную роль в развитии аутоиммунных процессов [2].

С нарушением образования противомикроб-ных пептидов, повышением или снижением их

экспрессии связывают развитие, течение и исход воспалительных процессов в полости рта [3]. Однако роль их в развитии воспалительных заболеваний пародонта, особенно у беременных женщин, находится на начальных этапах изучения. Патогенетическое значение антимикробных пептидов при беременности было изучено при развитии кариеса зубов [4]. Это обосновывает актуальность дальнейших исследований иммунных механизмов в развитии хронического генерализованного пародонтита (ХГП) и разработки информативных критериев диагностики и течения этих заболеваний у беременных женщин.

Целью исследования является определить в динамике беременности при ХГП средней степени тяжести изменение активности антимикробных врожденных механизмов полости рта.

Материалы и методы исследования.

Оценка содержания в ротовой жидкости антимикробного пептида кателицидина LL-37 осуществлялась у 42 беременных с ХГП средней степени тяжести (клиническая группа) в динамике гестационного периода: первый триместр -8-12 недель, второй триместр — 13-27 недель, третий триместр беременности — 28-40 недель. Для исследования использовали ротовую жидкость, собранную натощак, утром с 8 до 10 часов утра, без стимуляции в пластиковые пробирки BD Vacutainer («BD Bioscience»). В ротовой жидкости методом иммуноферментного анализа при помощи набора реактивов фирмы «Hycult Biotech human LL-37 ELISA» (Нидерланды) определяли кателицидин LL-37. Результат выражали в мкг/мл. В ходе ИФА использовались тер-мошейкер ST3 (Латвия) и аппарат для промывания планшетов Elisa Washer Human (США), оценку полученных результатов проводили на фотометре Multilabel Counter 1420 Victor (Финляндия).

В две контрольные группы были объединены 31 беременная женщина с физиологически протекающей беременностью и отсутствием стоматологических болезней и 32 здоровая женщина волонтерской группы.

Содержание кателицидина LL-37 (мкг/мл) в ]

В клинической группе возраст колебался от 18 до 39 лет, среди здоровых беременных женщин — от 18 до 34 лет и в группе здоровых доноров — от 17 до 40 лет. Средний возраст беременных женщин клинической группе составил 28,1±1,7 лет, среди здоровых беременных женщин -25,8±1,9 лет и в группе здоровых доноров — 26,3±2,0 лет.

Все исследования у здоровых и больных людей выполнены с их информированного согласия и соответ ствовали этическим принципам, предъявляемым Хельсинской Декларацией Всемирной Медицинской Ассоциации (World Medical Association Declaration of Helsinki, 2000), этических стандартов Комитета по экспериментам, стандартам проведения клинических исследований GCP (ГОСТ Р 52379 — 2005).

Статистическая обработка результатов будет проведена с использованием пакета прикладного программного обеспечения Statistica 7.0.

Результаты и обсуждение. Содержание антимикробного пептида кателицидина LL-37 в ротовой жидкости в группах обследуемых представлено в таблице 1.

Таблица 1

й жидкости в группах обследуемых (M±m)

Группа Этап гестационного периода

8-12 нед. (1 триместр) 13-27 нед. (2 триместр) 28-40 нед. (3 триместр)

Клиническая группа, п=42 38,6±3,2*° 65,3±3,8*° 21,4±1,1*°

Здоровые беременные женщины, п=31 20,4±1,2* 23,4±1,5 27,4±1,9

Здоровые доноры, п=32 25,1±1,6

Примечание: * — достоверные отличия по сравнению со здоровыми донорами прир<0,05, ° — достоверные отличия по сравнению со здоровыми беременными женщинами без стоматологических заболеваний

У беременных женщин с физиологически протекающей беременностью и без стоматологической патологии по сравнению со здоровыми донорами в 1 триместре беременности наблюдалось статистически значимое снижение содержания кателицидина LL-37 в ротовой жидкости на 18,7% (р<0,05). Затем во 2 и 3 триместры содержание данного антимикробного пептида не отличалось (р>0,05) от уровня у здоровых доноров. Следовательно, депрессия изучаемого антимикробного фактора врожденной иммунной защиты

ротовой полости в первом триместре беременности была характерна и при отсутствии стоматологических болезней.

Уровень антимикробных пептидов в настоящее время рассматривается как маркер активации воспалительного процесса различного ге-неза [5]. Кателицидины, имеющие широкий спектр противомикробной активности, включая грамотрицательные и грамположительные бактерии, грибы, некоторые вирусы, наряду с антибактериальной активностью играют важную

роль в воспалении. Кателицидины влияют на экспрессию провоспалительных цитокинов, являются хемотаксическим фактором для нейтро-филов, моноцитов, тучных клеток, нейтрализуют эндотоксины [6, 7]. Так, кателицидин LL-37 оказывает прямое воздействие и способствует снижению выработки провоспалительного фактора некроза опухоли-а [6]. Повышение содержания кателицидина LL-37 в ротовой жидкости у беременных пациенток с ХГП средней степени тяжести в 1 и 2 триместры беременности можно рассматривать как активацию врожденного антимикробного фактора, направленную на ограничение патогенного потенциала этиологическии значимых микробных возбудителей. У пациенток клинической группы содержание кателици-дина LL-37 в ротовой жидкости по сравнению со здоровыми беременными женщинами было выше в 1 триместр на 89,2% (р<0,001), а во 2 триместр в 2,8 раза (р<0,001).

Однако, в 3 триместр беременности содержание кателицидина LL-37 в ротовой жидкости у беременных пациенток клинической группы снижалось до 21,4±1,1 мкг/мл и было статистически значимо ниже (р<0,001) аналогичного показателя здоровых беременных женщин в 3 триместре беременности (27,4±1,9 мкг/мл), а также по отношению к здоровым волонтерам (25,1±1,6 мкг/мл). Итак, если у беременных женщин с физиологически протекающей беременностью и без стоматологической патологии в динамике ге-стационного периода содержание кателицидина LL-37 в ротовой жидкости повышалось, то при ХГП средней степени тяжести наблюдалась иная картина. Ко 2 триместру беременности содержание кателицидина LL-37 в слюне в клинической группе повышалось, а к 3 триместру прогрессивно снижалось, являясь признаком иммунодефицита.

Таким образом, у беременных женщин с ХГП средней степени тяжести в 3 триместре беременности антимикробный потенциал кателицидина LL-37 в ротовой полости снижался. Этот факт является обоснованием для поиска маркеров индукции антимикробных пептидов в целью сдерживания воспалительных изменений в пародонте и основанием для активизации профессиональных гигиенических мероприятий в ротовой полости при беременности.

Выводы:

1. У беременных женщин с физиологически протекающей беременностью и при отсутствии стоматологических заболеваний в 1 триместре наблюдается снижение содержания кателицидина LL-37 в ротовой жидкости с последующим ростом во 2 и 3 триместры антимикробного потенциала биологичекой среди ротовой полости

2. У беременных женщин при ХГП средней степени тяжести в первые два триместра повышенное содержание кателицидина LL-37 в ротовой жидкости способствует повышению антимикробных врожденных механизмов резистентности к патогенным бактериям с последующим снижением антимикробного фактора к 3 триместру гестационного периода.

3. Дефицит кателицидина LL-37 в ротовой жидкости в 3 триместре беременности у пациенток с ХГП средней степени тяжести является отражением угнетения антимикробной врожденной защиты ротовой полости и фактором, способствующим прогредиентному течению стоматологического заболевания.

ЛИТЕРАТУРА

1. Бутюгин И.А., Долгушин И.И., Ронь Г.И. Кли-нико-иммунологическая характеристика пациентов с хроническим генерализованным пародонтитом // Уральский медицинский журнал. 2014. № 5. С. 34-38.

2. Шамова О.В., Орлов Д.С., Кокряков В.Н., Корнева Е.А. Антимикробные пептиды в реализации различных защитных функций организма. // Медицинский академический журнал. 2013. №3. С.42-52.

3. Кулакова Е.В., Елизарова В.М., Пампура А.Н. Эндогенные антимикробные полипептиды-факторы неспецифической защиты организма // Российский стоматологический журнал. 2012. №6. С. 42-45.

4. Проходная В.А. Патогенетическое значение антимикробных пептидов ротовой полости для рецидивирова-ния кариеса зубов у беременных женщин // Стоматология для всех. 2015. №2. С.32-35.

5. Окороченков С.А., Желтухина Г.А., Небольсин В.Е. Антимикробные пептиды: механизмы действия и перспективы практического применения // Биомедицинская химия. 2012. №2. С. 131-143.

6. Yount N.Y., Yeaman M.R. Immunoconsiluum: Perspectives in Antimicrobial. Peptide Mechanisms of Action and Resistance // Protein and Peptide Letters. 2005. Vol. 12. P. 4967.

7. Dale B.V., Fredericks L.P. Antimicrobial peptides in oral environment: expression and function in Health and disease // Curr. Issues. Mol. Biol. 2005. Vol.7. №2. P. 119-133.

ANTIMICROBIAL FEATURES ORAL IMMUNITY IN PREGNANT WOMEN WITH CHRONIC GENERALIZED PERIODONTITIS WITHIN GESTATION

Surmeneva1 S.O., Lapinа2 N. V., Chibichjan1 E.H.

‘Rostov State Medical University, Health Ministry Russia, Rostov-on-Don, Russia. 2Kuban State Medical University, Health Ministry Russia, Krasnodar, Russia.

Annotation. In an article in the course of pregnancy in chronic generalized periodontitis (CGP) moderate studied changes in the concentration of the antimicrobial peptide cathelicidin LL-37 in oral fluid. In pregnant women with CGP moderate during the first two trimesters high content of cathelicidin LL-37 in the saliva contributes to the innate antimicrobial resistance mechanisms in pathogenic bacteria, followed by reduction of the antimicrobial factors in 3 trimester of gestation. This fact is a justification for finding the induction of antimicrobial peptides in order to curb markers of inflammatory changes in the periodontium and the basis for the activation of professional hygiene measures in the oral cavity during pregnancy.

Key words. pregnancy, chronic generalized periodontitis, oral liquid, antimicrobial peptides, gestational period.

REFERENCES

1. Butjugin I.A., Dolgushin I.I., Ron’ G.I. Clinical and immunological characteristics of patients with chronic generalized periodontitis. Ural’skij medicinskij zhurnal, 2014, №5, pp. 34-38 (in Russian).

2. Shamova O.V., Orlov D.S., Kokrjakov V.N., Korneva E.A. Antimicrobial peptides in the implementation of the various protective functions of the organism. Medicinskij akademicheskij zhurnal. 2013. №3. pp.42-52 (in Russian).

3. Kulakova E.V., Elizarova V.M., Pampura A.N. Endogenous antimicrobial polypeptides factors of nonspecific protection of an organism. Rossijskij stomatolog-icheskij zhurnal. 2012. №6. pp. 42-45 (in Russian).

4. Prohodnaja V.A. Pathogenetic importance of antimicrobial peptides mouth to the recurrence of dental caries in pregnant women. Stomatologija dlja vseh, 2015, №2, pp.32-35 (in Russian).

5. Okorochenkov S.A., Zheltuhina G.A., Nebol’sin V.E. Antimicrobial peptides: mechanisms of action and practical perspective. Biomedicinskaja himija. 2012. №2. S. 131-143 (in Russian).

6. Yount N.Y., Yeaman M.R. Immunoconsiluum: Perspectives in Antimicrobial. Peptide Mechanisms of Action and Resistance. Protein and Peptide Letters. 2005. Vol. 12. P. 49-67.

7. Dale B.V., Fredericks L.P. Antimicrobial peptides in oral environment: expression and function in Health and disease. Curr. Issues. Mol. Biol. 2005. Vol.7. №2. P. 119-133.

Положение о режиме в МКОУ СОШ ХГП

Принято                                                                                       «УТВЕРЖДАЮ»

на заседании пед. совета школы                                    Директор МОУ СОШ ХГП 

Протокол №    от                                                            __________Л.А. Глущенко                                     

                                                                                        «____»__________2017   г.

 

 

                        Положение о режиме в МКОУ СОШ ХГП

 

        1. Режим функционирования образовательного учреждения устанавливается на основе требования санитарных норм СанПиН 2.4.2.2821-10 и СанПиН.4.1.2660-10, Типового Положения об общеобразовательном учреждении, Типового положения о дошкольном образовательном учреждении, Закона РФ «Об образовании», Устава ОУ, учебного плана образовательного учреждения и Правил внутреннего распорядка.

       2. Учебный год в школе начинается 1 сентября. Если этот день приходится на выходной, то в этом случае учебный год начинается в первый, следующий за ним рабочий день. Продолжительность учебного года определяется ежегодным календарным графиком по согласованию с Учредителем – отделом образования Кавалеровского  муниципального района.

       3. Продолжительность каникул устанавливается в течение учебного года сроком 30 календарных дней, летом — не менее 8 недель. Для обучающихся в первых классах устанавливаются в третьей четверти дополнительные недельные каникулы. Школа самостоятельно определяет регламент работы, оформляемый приказом директора школы на начало года.

       4. Режим функционирования образовательного учреждения согласовывается с Учредителем.

       5. Школа работает в одну смену.

       6. Школа устанавливает пяти- и шестидневную учебную неделю с учётом санитарно-гигиенических требований. В 1-8 классах установлена пятидневная учебная неделя, в 9-11 классах – шестидневная учебная неделя.

       7. Занятия в школе начинаются в 8-30 ч. для учащихся 5-11 классов и в 9-25ч. для учащихся 1-4 классов. Продолжительность урока во 2-11 классах составляет 45 минут, в 1 классе устанавливается ступенчатый режим согласно требованиям СанПиН 2.4.2.2821-10 и СанПиН.4.1.2660-10: в первом полугодии (в сентябре, октябре — по 3 урока в день по 35 минут каждый с ежедневной динамической паузой, продолжительностью 40 минут, в ноябре-декабре – по 4 урока по 40 минут каждый; январь – май – по 4 урока по 45 минут каждый). Проведение «нулевых» уроков в образовательном учреждении не допускается.

       8. Продолжительность перемен — 10 минут, перерывы для обедов по 20 минут.

      9. Занятия кружков и секций начинаются через час после окончания уроков.

     10. В воскресенье и праздничные дни образовательное учреждение не работает.

     11. Образовательный процесс осуществляется в соответствии с основной образовательной программой начального общего, основного общего и среднего (полного) общего образования.

     12. Учебные занятия проводятся в соответствии с санитарно-гигиеническими правилами и возрастом обучающихся и воспитанников, учебным планом и сеткой занятий, утверждёнными директором образовательного учреждения.

     13. Количество классов в школе определяется в зависимости от числа поданных заявлений, с учетом санитарных норм и контрольных нормативов, указанных в лицензии. Наполняемость классов не должна превышать 25 человек. На занятиях в кружках, секциях при изучении иностранного языка, информатики, наполняемость каждой группы не должна превышать 12 человек.

     14. На бесплатной основе обучающимся школа оказывает следующие дополнительные образовательные услуги:

* работа факультативов,

* групповые и индивидуальные занятия;

* спортивные секции;

* кружковая работа.

     15. Классные часы проводятся один раз в неделю, тематические классные часы один раз в месяц. В воскресные дни в школе могут проводиться массовые мероприятия с участием учащихся и педагогических работников по плану воспитательной работы школы.

     16. Дисциплина в школе поддерживается на основе уважения человеческого достоинства обучающихся. Применение методов физического и психического насилия по отношению к обучающимся не допускается.

     17. Образовательное учреждение создает условия, гарантирующие охрану и укрепление здоровья обучающихся, воспитанников.

     18. Учебная нагрузка, режим занятий обучающихся определяются Уставом образовательного учреждения на основе рекомендаций, согласованных с органами здравоохранения.

     19. Расписание занятий в образовательном учреждении должно предусматривать перерыв достаточной продолжительности для питания обучающихся.

 

МКУ «ХОЗУ Администрации ХГП»

Муниципальное казённое учреждение 
«Хозяйственное управление Администрации Хасанского городского поселения»

 

Краткое наименование: МКУ «ХОЗУ Администрации  ХГП»

Юридический адрес: 692730, Приморский край, Хасанский район, пгт. Хасан, ул. Вокзальная, д. 7

Директор Учреждения: Лескова Алёна Олеговна, 10.12.1991 года рождения, образование высшее, назначен на должность Распоряжением главы № 9-л от 13.04.2020 года «О назначении на должность директора Муниципального казенного учреждения «Хозяйственное управление Администрации Хасанского городского поселения»»

Главный бухгалтер: Федоренко Виктория Олеговна

Учредитель: Администрация Хасанского городского поселения Хасанского муниципального района Приморского края

Вид: муниципальное учреждение

Тип учреждения: казенное

Специализация: учреждение по хозяйственному обслуживанию муниципального имущества

Основная цель Учреждения: хозяйственное обеспечение деятельности органов местного самоуправления Хасанского городского поселения (исполнение полномочий администрации) 

ИНН: 2531011318

КПП: 253101001

ОГРН: 1112502000050

Код ОКПО (Росстат): 68549648

Код ОКАТО: 05248570000

Код ОКТМО: 05648170

Банк получателя: Дальневосточное ГУ Банка России

Контактный телефон / факс: 8 (42331) 28-7-33

E-mail: [email protected]

График работы: 

  • понедельник-пятница: с 9-00 ч. до 18-00 ч.

  • перерыв: с 13-00 ч. до 14-00 ч.

  • выходные: суббота,воскресенье, праздничные дни

Профессиональный риск развития хронического генерализованного пародонтита и бруксизма у работников добычи известняка | Хайбуллина

1. Бойкова Е. И., Гелетин П.Н., Гинали Н.В., Маслова Н.Н., Юрьева Н.В. К вопросу о терминологии и классификации бруксизма. Бюллетень сибирской медицины. 2013;12(5):99-103.

2. Орлова О.Р., Алексеева А.Ю., Мингазова Л.Р., Коновалова З.Н. Бруксизм как неврологическая проблема (обзор литературы). Нервно-мышечные болезни 2018; 8(1):20–7.

3. Наврузова У.О. Современные аспекты этиопатогенеза генерализованного пародонтита (обзор литературы). Биология и интегративная медицина. 2019; 2(30):62-63.

4. Крайнов С.В., Михальченко В.Ф., Яковлев А.Т.,Попова А.Н., Алеханова И.Ф. Глубина пародонтального карманам или величина потери прикрепления, каой параметр выбрать в геронтостоматологии? Проблемы стоматологии, 2017; 13 (4): 9-14.

5. Рахматуллина Р.З., Хайбуллина М.Ф., Герасимова Л.П., Кабирова М.Ф., Рахматуллин Р.Н. Способ лечения воспалительных заболеваний пародонта. 2019; (31) RU 2705409 C1.

6. Зюлькина Л.А., Сабаева М.Н., Иванов П.В., Шастин Е.Н. Микроциркуляция тканей пародонта: причины нарушений и механизмы коррекции. Современные проблемы науки и образования.2017.

7. Губайдуллин И.Р., Герасимова Л.П., Усманова И.Н., Кабирова М.Ф., Хайбуллина Р.Р., Чемикосова Т.С., Кузнецова Л.И. Оценка микроциркуляторного русла суставного хряща височно-нижнечелюстного сустава в возрастном аспекте. Морфология. 2019; 155(2): 88.

8. Уманская Ю. Н. Комплексная диагностика и реабилитация пациентов с дисфункцией височно-нижнечелюстного сустава, ассоциированной с дисплазией соединительной ткани. Диссертация кандидата медицинских наук. 2014: 160.

9. Гвасалян, Л.В. Сравнительная оценка аппаратных методов диагностики заболеваний височно-нижнечелюстного сустава. автореф. дис. канд. мед. наук Л. В. Гвасалян. 2012: 25.

10. Бакаев Ю.А., Хабадзе З.С., Морданов О.С., Генералова Ю.А. Лечение хронического генерализованного пародонтита с использованием наноматрицы, содержащей мирамистин, как поддерживающей терапии: пилотное исследование и ранние результаты. Эндодонтия Today. 2020;18(3):78-81.

11. Морозов П.В., Иорданишвили А.К.Сочетанное поражение эндодонта и пародонта у взрослых и его причины. Эндодонтия Today. 2019;17(2):41-46.

12. Долгалев А.А., Нечаева Н.К., Аракелян Н.Г., Дзугоева А.Х. Возможности конусно-лучевой компьютерной томографии при диагностике переломов корней зубов. Эндодонтия Today. 2018;16(2):43-47.

13. Ушницкий И.Д., Иванова А.А., Пинелис И.С., Юркевич А.В., Михальченко Д.В. Современные этиологические и патогенетические аспекты воспалительнодеструктивных процессов тканей пародонта. Эндодонтия Today. 2019;17(4):46-49

14. Гоменюк Е.В., Гоменюк Т.Н., Вейсгейм Л.Д. Междисциплинарный подход к диагностике и лечению парафункций жевательных мышц на примере клинического случая. Эндодонтия Today. 2018;16(2):48-55.

15. Хайбуллина Р. Р., Гильмутдинова Л.Т., Герасимова Л.П. Программа медицинской реабилитации пациентов с хроническим генерализованным пародонтитом средней степен и тяжести. Уральский медицинский журнал. 2016; 7 (140): 10-14.

16. Зайдуллин И.И., Кабирова М.Ф., Галимова Р. Р., Каримов Д.О., Валеева Э.Т. Оценка распространенности основных пародонтопатогенов у работников нефтехимического производства с хроническим пародонтитом. Проблемы стоматологии. 2018; 14(32): 20-25.

17. Зайдуллин И.И., Каримова Л.К., Кабирова М.Ф., Садртдиова Г.Р., Галимова Р. Р., Валеева Э.Т. Использование микроядерного теста для оценки состояния пародонта у работников, подвергающихся воздействию вредных веществ. Гигиена и санитария. 2020; 99(9): 956-960.

18. Хайбуллина Р. Р., Гильмутдинова Л.Т., Герасимова Л.П., Хайбуллина З.Р. Применение комплекса лечебных средств на основе натуральных компонентов в реабилитации пациентов с хроническим генерализованным пародонтитом. Вестник восстановительной медицины. 2017;1: 85-89.

19. Хайбуллина Р. Р., Герасимова Л.П., Гильмутдинова Л.Т. Применение современных физиотерапевтических технологий в лечении пациентов с заболеваниями пародонта и бруксизма. Уральский медицинский журнал. 2015; 6: 96-100.

20. Хайбуллина Р. Р., Герасимова Л.П., Хайбуллина А.Р. Гемодинамические показатели сосудов пародонта у пациентов с хроническим генерализованным пародонтитом. Журнал научных статей Здоровье и образование в XXI веке. 2017; 19, 9: 62-65

Прогнозирование прогрессирования хронического генерализованного пародонтита у пациентов с бронхоэктатической болезнью | Саркисов

1. Субанова А.А. Особенности эпидемиологии и патогенеза заболеваний пародонта (обзор литературы). Вестник Кыргызско-Российского Славянского университета. 2015; 15(7): 152–155.

2. Tonetti M.S., Jepsen S., Jin L., Otomo-Corgel J. Impact of the global burden of periodontal diseases on health, nutrition and wellbeing of mankind: A call for global action. J. Clin. Periodontol. 2017; 44(5): 456– 462. DOI: 10.1111/jcpe.12732

3. Prathypaty S.K., Akula M., Darapla A., Dhulipala M., Vedula C. Prevalence of different forms of periodontitis in patients visiting government dental college and hospital, hyderabad, since last decade: a retrospective study. J. Indian. Soc. Periodontol. 2019; 23(4): 367–370. DOI: 10.4103/jisp.jisp_698_18

4. Araújo M.M., Albuquerque B.N., Cota L.O.M., Cortelli S.C., Cortelli J.R., Costa F.O. Periodontitis and periodontopathogens in individuals hospitalized in the intensive care unit: a case-control study. Braz. Dent. J. 2019; 30(4): 342–349. DOI: 10.1590/0103-6440201902480

5. Listyarifah D., Al-Samadi A., Salem A., Syaify A., Salo T., Tervahartiala T., Grenier D., Nordström D.C., Sorsa T., Ainola M. Infection and apoptosis associated with infl ammation in periodontitis: An immunohistologic study. Oral. Dis. 2017; 23(8): 1144–1154. DOI: 10.1111/odi.12711

6. Matthews D.C. Prevention and treatment of periodontal diseases in primary care. Evid. Based. Dent. 2014; 15(3): 68–69. DOI: 10.1038/sj.ebd.6401036

7. Lertpimonchai A., Rattanasiri S., Tamsailom S., Champaiboon C., Ingsathit A., Kitiyakara C., Limpianunchai A., Attia J., Sritara P., Thakkinstian A. Periodontitis as the risk factor of chronic kidney disease: Mediation analysis. J. Clin. Periodontol. 2019; 46(6): 631–639. DOI: 10.1111/jcpe.13114

8. Бабеня А.А. Особенности проявления стоматологической патологии у лиц с заболеваниями желудочно-кишечного тракта (Обзор литературы). Инновации в стоматологии. 2015; 1: 72–75. 9. Бурягина Н.В. Хроническая оральная инфекция на фоне ишемической болезни сердца. Фундаментальные исследования. 2013; 5-2: 250–255.

9. Candeo L.C., Rigonato-Oliveira N.C., Brito A.A, Marcos R.L., França C.M., Fernandes K.P.S., Mesquita-Ferrari R.A., Bussadori S.K., Vieira R.P., Lino-Dos-Santos-Franco A., Ligeiro-Oliveira A.P., Horliana A.C.R.T. Effects of periodontitis on the development of asthma: The role of photodynamic therapy. PLoS One. 2017; 12(11): e0187945. DOI: 10.1371/ journal.pone.0187945

10. Саркисов К.А., Полунина О.С., Брагин Е.А., Воронина Л.П., Нуржанова И.В. Состояние базального кровотока у больных хроническим пародонтитом на фоне бронхиальной астмы. Астраханский медицинский журнал. 2010; 5(3): 100–102.

11. Shi Q., Zhang B., Xing H., Yang S., Xu J., Liu H. Patients with Chronic Obstructive Pulmonary Disease Suffer from Worse Periodontal Health-Evidence from a Meta-Analysis. Front. Physiol. 2018; 9: 33. DOI: 10.3389/fphys.2018.00033

12. Chapple I.L., Sapey E., Stockley R.A. Is periodontitis a comorbidity of COPD or can associations be explained by shared risk factors/behaviors? Int. J. Chron. Obstruct. Pulmon. Dis. 2017; 12: 1339–1349. DOI: 10.2147/COPD.S127802

13. Воронина Л.П., Полунина О.С., Севостьянова И.В., Кудряшева И.А., Кагин А.В., Сердюков В.Г. Влияние оксидативного стресса на микрососудистый эндотелий при бронхиальной астме. Астраханский медицинский журнал. 2013; 8(4): 54–57.

14. Горбачёва И.А., Орехова Л.Ю., Сычёва Ю.А., Чудинова Т.Н., Михайлова О.В. Факторы взаимного отягощения множественных хронических очагов инфекции и генерализованного пародонтита. Ученые записки СПбГМУ им. акад. И.П. Павлова. 2018; 25(1): 50–55. DOI: 10.24884/1607-4181-2018-25-1-50-55

15. Ambati M., Rani K.R., Reddy P.V., Suryaprasanna J., Dasari R., Gireddy H. Evaluation of oxidative stress in chronic periodontitis patients following systemic antioxidant supplementation: A clinical and biochemical study. J. Nat. Sci. Biol. Med. 2017; 8(1): 99–103. DOI: 10.4103/0976-9668.198366

16. Mesia R., Gholami F., Huang H., Clare-Salzler M., Aukhil I., Wallet S.M., Shaddox L.M. Systemic infl ammatory responses in patients with type 2 diabe tes with chronic periodontitis. BMJ Open Diabetes Res. Care. 2016; 4(1): e000260. DOI: 10.1136/bmjdrc-2016-000260

17. Агарков Н.М., Гонтарев С.Н., Гонтарева И.С., Луценко В.Д., Яковлев А.П. Моделирование сдвигов и корреляционных связей гематологических и иммунологических показателей у больных хроническим генерализованным пародонтитом. Стоматология. 2016; 95(6): 12–16. DOI: 10.17116/stomat201695612-16

18. Царев В., Атрушкевич В., Галиева Д., Школьная К. Микробный пейзаж содержимого пародонтальных карманов и корневых каналов у пациентов с эндодонто-пародонтальными поражениями IV класса. Пародонтология. 2016; 21(1):13–17.

19. Saleh A.D., Chalmers J.D., De Soyza A., Fardon T.C., Koustas S.O., Scott J., Simpson A.J., Brown J.S., Hurst J.R. The heterogeneity of systemic infl ammation in bronchiectasis. Respir. Med. 2017; 127: 33–39. DOI: 10.1016/j.rmed.2017.04.009

20. Dandekar A., Mendez R., Zhang K. Cross talk between ER stress, oxidative stress, and infl ammation in health and disease. Methods Mol. Biol. 2015; 1292: 205–214. DOI: 10.1007/978-1-4939-2522-3_15

21. Camps J., García-Heredia A. Introduction: oxidation and infl ammation, a molecular link between non-communicable diseases. Adv. Exp. Med. Biol. 2014; 824: 1–4. DOI: 10.1007/978-3-319-07320-0_1

22. Пародонтит. Общие клинические рекомендации. Версия: Клинические рекомендации РФ (Россия). MedElement; 2020. Доступно: https://diseases.medelement.com/disease/пародонтит-рекомендации-рф/15120

23. Cholewa M., Madziarska K., Radwan-Oczko M. The association between periodontal conditions, infl ammation, nutritional status and calcium-phosphate metabolism disorders in hemodialysis patients. J. Appl. Oral. Sci. 2018; 26: e20170495. DOI: 10.1590/1678-7757-2017-0495

24. Петрухина Н.Б., Зорина О.А., Ших Е.В., Картышева Е.В. Прогностическая модель для оценки хронического генерализованного пародонтита у пациентов с метаболическим синдромом. Вестник Российского государственного медицинского университета. 2019; 2: 48–52. DOI: 10.24075/ vrgmu.2019.026

25. Lai H., Su C.W., Yen A.M., Chiu S.Y., Fann J.C., Wu W.Y., Chuang S.L., Liu H.C., Chen H.H., Chen L.S. A prediction model for periodontal disease: modelling and validation from a National Survey of 4061 Taiwanese adults. J. Clin. Periodontol. 2015; 42(5): 413– 421. DOI: 10.1111/jcpe.12389

26. Krois J., Graetz C., Holtfreter B., Brinkmann P., Kocher T., Schwendicke F. Evaluating Modeling and Validation Strategies for Tooth Loss. J. Dent. Res. 2019; 98(10): 1088–1095. DOI: 10.1177/0022034519864889

Возможности лечения больных хроническим генерализованным пародонтитом в современных условиях | Цепов

1. Голева Н. А. Оптимизация лечения и профилактики воспалительных заболеваний пародонта у студентов: автореф. дис. … к.м.н. — Смоленск, 2011. — 18 с.

2. Жажков Е. Н. Комплексное лечение хронического катарального гингивита и пародонтита легкой степени с использованием плазменного потока аргона: Автореф. дис. … канд. мед. наук. — Смоленск, 2000. — 20 с.

3. Зорина О. А., Аймадинова Н. К., Басова А. А., Ребриков Д. В. Взаимосвязь молекулярно-генетических маркеров с клиническими признаками и факторами риска развития пародонтита // Стоматология. 2016. №5. С. 12-18.

4. Ковалева О. В. Применение куриозина в комплексном лечении хронического генерализованного пародонтита: Автореф. дис. … канд. мед. наук. — Смоленск, 2007. — 22 с.

5. Лазебник Л.Б. Формирование полиморбидности в социуме // Клиническая геронтостоматология. 2015. №3-4. С. 3-7.

6. Левченкова Н. С. Электрокинетическая подвижность ядер клеток буккального эпителия при генерализованном пародонтите: Автореф. дис. … канд. мед. наук. — Смоленск, 1996. — 19 с.

7. Михеева Е. А. Применение ксидифона в комплексной терапии хронического генерализованного пародонтита у больных сахарным диабетом 2 типа: Автореф. дис. … канд. мед. наук. — Смоленск, 2004. — 18 с.

8. Нестерова М. М. Комплексное лечение больных пародонтитом, ассоциированным с патогенным минералообразованием: Автореф. дис. … канд. мед. наук. — Смоленск, 2013. — 18 с.

9. Николаев А. И. Особенности развития и лечения кариеса и пародонтита у больных язвенной болезнью желудка и двенадцатиперстной кишки (клинико-экспер. исследование): Автореф. дис. … канд. мед. наук. — Смоленск, 1998. — 22 с.

10. Петрова Е. В. Аппликационные сорбенты в комплексном лечении пародонтита: Автореф. дис. … канд. мед. наук. — Тверь, 1993. -19 с.

11. Романенко И. Г., Чепурова Н. И. Роль орального дисбиоза в развитии заболеваний полости рта // Эндодонтия today. 2016. №2. С. 66-71.

Проект «Геном человека»

Основной целью проекта «Геном человека» (HGP), который был запущен в 1990 году, было секвенирование 3 миллиардов оснований генома человека. Дополнительные цели включали создание физических и генетических карт генома человека, а также картографирование и секвенирование ключевых модельных организмов, используемых в биомедицинских исследованиях.

В 1998 году HGP официально реализовала Бермудские принципы, в частности следующие: автоматическое высвобождение сборок последовательностей размером> 1 kb, предпочтительно в течение 24 часов; немедленная публикация готовых аннотированных последовательностей; а также обеспечение свободного доступа ко всей последовательности как для исследований, так и для разработки, чтобы максимизировать ее пользу для общества.В обмен на немедленный онлайн-выпуск данных о последовательностях, финансируемых HGP, исследовательские группы из США, Великобритании, Японии, Франции, Германии и Китая, проводившие секвенирование, сохранили право первыми описывать свои полные наборы данных и анализировать свои выводы в рецензируемые публикации.

Настаивая на Бермудских принципах, HGP стремилась подорвать усилия сторон, нацеленных на патентование или коммерциализацию геномных последовательностей человека, что могло ограничить последующие исследования.В 1998 году было объявлено, что новая компания, позже переименованная в Celera Genomics, будет «гонять» за финансируемым государством HGP, чтобы завершить секвенирование генома человека. Celera Genomics также намеревалась продавать подписки на свою базу данных, ежеквартально публиковать данные и получать патенты на гены и связанные с ними технологии.

Это новое присутствие угрожало выживанию HGP (который к началу 1998 г. секвенировал лишь небольшую часть генома человека), но после того, как президент США Клинтон и премьер-министр Великобритании Тони Блэр 14 марта 2000 г. совместно заявили, что последовательность генома человека «Должны быть доступны ученым повсюду в свободном доступе», — HGP и Celera Genomics заключили сделку, которая привела к одновременной публикации в феврале 2001 года двух статей (Venter et al.в Science и International Human Genome Sequencing Consortium в Nature ), описывающих черновую последовательность генома человека. Последовательность включала 26 588 кодирующих белок транскриптов, для которых имелись убедительные подтверждающие доказательства, и дополнительно ~ 12 000 генов, полученных с помощью вычислений, с гомологами мыши или другими слабыми доказательствами.

HGP использовал иерархический подход к секвенированию, при котором геном был разбит на сегменты размером ~ 150 т.п.н. и клонирован в бактериальные искусственные хромосомы перед сопоставлением с физической картой всего генома, включающей> 96% эухроматической части геном человека (~ 94% всего генома человека).Отобранные бактериальные искусственные хромосомы секвенировали и, наконец, повторно собирали для создания черновой последовательности. В отличие от этого, Celera Genomics использовала как HGP, так и свои собственные личные данные в своем подходе к секвенированию целого генома, который фрагментировал геном на сегменты размером ~ 500 п.н. и подвергал их попарному концевому секвенированию (в котором данный фрагмент секвенируется с обоих концов). для создания «пары помощников»), чтобы восстановить исходную последовательность.

В 2003 году группа из ~ 40 профессионалов, работающих в области геномики, публично заявила о своей поддержке свободного и неограниченного использования данных секвенирования генома научным сообществом перед официальной публикацией.Эта декларация, известная как Форт-Лодердейлское соглашение, закрепила коллективную ответственность финансирующих агентств, производителей ресурсов и пользователей за поддержание и расширение общего хранилища геномных данных. Эти принципы позже были реализованы в качестве политики несколькими финансирующими агентствами, в частности Национальным институтом здравоохранения США (NIH), который сегодня по-прежнему требует быстрого обмена данными в своих требованиях к грантам. В совокупности эти инициативы можно считать предшественниками публикации открытого доступа в биомедицине.

В 2004 году работа HGP завершилась публикацией высокоточной (~ 1 ошибка на 100 000 оснований) последовательности человеческого генома, которая включала ~ 99% эухроматического генома. Текущая версия эталонного генома человека, GRCh48.p13, включает 3,27 миллиарда нуклеотидов и 19 116 ядерных генов, кодирующих белок.

Сегодня HGP по-прежнему примечателен примерно 800 миллиардами долларов дохода и изменениями парадигмы, вызванными этим финансируемым государством «большим научным» проектом. Предлагая первый взгляд на весь геном человека, HGP послужил воротами в эру высокопроизводительной цифровой биологии, положив начало быстрым технологическим и вычислительным разработкам и исследованиям, ориентированным на команду, плоды которых по-прежнему ощущаются в клинической практике. и науки о жизни.

Дополнительная литература

Международный консорциум по секвенированию генома человека. Завершение эухроматической последовательности генома человека. Природа 431 , 931–945 (2004).

Максон Джонс, К., Анкени, Р. А. и Кук-Диган, Р. Бермудский треугольник: прагматика, политика и принципы обмена данными в истории проекта генома человека. J. Hist. Биол . 51 , 693–805 (2018).

Проект «Геном человека»

Проект «Геном человека»
Даниэль Мелаас
Авторское право 1999 г.

Введение

Проект «Геном человека» (HGP) — это международное совместное предприятие по выявлению и маркировке всех местоположений каждого гена человеческого вида.HGP в Соединенных Штатах был начат в 1990 году, и ожидалось, что это пятнадцатилетняя попытка составить карту генома человека. С 1990 года произошел ряд технологических достижений, которые ускорили продвижение проекта до даты завершения, которая наступит где-то в 2003 году. В состав HGP США входят Министерство энергетики (DOE) и Национальный институт здравоохранения (NIH). который надеется открыть от 50 000 до 100 000 человеческих генов и сделать их доступными для дальнейших биологических исследований (1).В проекте участвует ряд других стран, включая Австралию, Бразилию, Канаду, Францию, Германию, Японию и Соединенное Королевство (1). Помимо множества стран, участвующих в проекте, в секвенировании участвует также ряд коммерческих компаний (6). Совместная цена в 3 миллиарда долларов будет использована для секвенирования возможных 3 миллиардов пар оснований ДНК человека.

Возможности информации, которая будет получена из проекта, практически безграничны.Скорее всего, это изменит многие методы биологических и медицинских исследований, а также многие методы, используемые сегодня нашими профессионалами-медиками. Полученные знания помогут найти новые способы диагностики, лечения и, возможно, предотвращения заболеваний. Открытие генома человека открывает безграничные возможности для сельского хозяйства, здравоохранения и новых источников энергии. Конечным результатом HGP будет информация о структуре, функциях и организации ДНК, какой мы ее знаем сегодня.

Технические аспекты HGP

HGP поставил ряд целей, которые они надеются выполнить к дате завершения в 2003 году. Одна из первых целей проекта — выявить от 50 000 до 100 000 генов, обнаруженных в ДНК (2 , 3,4). Вторая цель HGP — секвенировать 3 миллиарда химических оснований, составляющих ДНК человека. Секвенирование ДНК — это процесс определения порядка «основ» химических строительных блоков, из которых состоит ДНК хромосомы человека.Затем эта информация будет сохранена в большой базе данных, чтобы ее могли использовать другие люди ». HGP надеется затем разработать инструменты для анализа этих данных. Наконец, HGP хотел бы обратиться к этическим, правовым и социальным вопросам, которые, несомненно, возникнут в результате проекта. По состоянию на 10/8/99 цель рабочего проекта последовательности 90% к лету 2000 года составляет 13,6% от цели (453 968 000 баз). Цель готовой высококачественной последовательности — 100% к 2003 году — 13.8% (466,883,000 баз) от своей цели (1).

В проекте используется ДНК четырех человек (5). Это возможно потому, что люди различаются по своему генетическому составу на 0,1% ДНК. Эти 0,1% составляют всю генетическую изменчивость, которую мы видим и признаем в современном обществе.

В проекте генома используется ряд различных методов для определения последовательности ДНК. Одним из них является использование нового масс-спектрофотометра высокого разрешения, оснащенного вакуумным ультрафиолетовым фотоионизатором, для секвенирования ДНК, меченной реценом (1).Эта новая технология может устранить необходимость как в гель-электрофорезе, так и в радиоактивной маркировке при секвенировании сегментов ДНК. Этот метод достигается с помощью праймера, помеченного металлоорганическим соединением, таким как ферроцен. Новые сегменты ДНК, которые заканчиваются при каждом появлении определенного основания ДНК, создаются на праймере с использованием исходной матрицы ДНК. Позже праймер считывается на времяпролетном масс-спектрофотометре с высоким разрешением, где определяются массы и последовательности.

Другой метод — автоматическое секвенирование ДНК. Этот процесс используется для ускорения задачи секвенирования ДНК. Есть ряд красителей, которые прикрепляются конкретно к основаниям ДНК (2). Затем фрагменты ДНК отправляются через стеклянную трубку, заполненную транспортным гелем. Затем фрагменты возбуждаются лазером, и каждый краситель приобретает определенный цвет. Эти цвета затем считываются компьютером, который дает последовательность ДНК.

Преимущества HGP

Преимущества проекта «Геном человека», скорее всего, ощутят во всем мире.Согласно прогнозам, к 2009 году расходы на исследования в области геномики в промышленности США составят 45 миллиардов долларов. Эта прогнозируемая сумма в долларах направлена ​​на продажу продуктов и технологий на основе ДНК в биотехнологической отрасли.

Одно из потенциальных преимуществ — в области молекулярной медицины. Преимущества в этой области могут включать лучшую диагностику заболеваний, раннее выявление определенных заболеваний, а также генную терапию и системы контроля лекарств (1). В будущем в молекулярной медицине должны появиться новые методы лечения, которые не устраняют симптомы, а рассматривают причины проблемы.

Еще одна область, которая может воспользоваться преимуществами HGP, — это геномика микробов. В этой области можно будет найти новые источники энергии посредством секвенирования бактериального генома. Это может привести к открытиям, которые будут полезны в производстве энергии, сокращении токсичных отходов и промышленной переработке (2).

HGP также может быть очень полезен для понимания эволюции человека и миграции людей. Это может помочь ученым узнать, как эволюционировали люди и как люди развиваются сегодня.Это также поможет понять общую биологию, которую мы разделяем со всеми живыми существами на Земле. Сравнение нашего генома с другими может помочь выявить ассоциации болезней с определенными чертами.

Последняя область, которая, несомненно, получит колоссальные выгоды от HGP, — это сельское хозяйство и животноводство. Эта технология может помочь в выращивании устойчивых к болезням, насекомым и засухе сельскохозяйственных культур, что позволит производить больше продукции для всего мира. Это также поможет вывести на рынок более здоровых, продуктивных и, возможно, устойчивых к болезням животных.

Этические вопросы HGP

Широкая общественность и люди в HGP проявили большую озабоченность по поводу этических проблем, связанных с проектом «Геном человека». Из-за этой озабоченности Министерство энергетики и Национальные институты здравоохранения выделили 3-5% своего годового бюджета для HGP на изучение этических, правовых и социальных вопросов (ELSI), задействованных в проекте (1,3). Использование секвенирования окажет глубокое влияние на генетический скрининг людей. Медицинские работники смогут взглянуть на геном человека и многое рассказать о нем, просто взглянув на его гены.Эта новая технология вызовет ряд проблем, таких как справедливое использование генетической информации. Этот вопрос в основном нацелен на то, кто должен иметь доступ к генетическим записям и как их можно использовать. Некоторые из этих жертв — страховые компании, работодатели, суды, школы и военные. Если эта информация будет использована некоторыми из этих агентств, возможна дискриминация на основе генетических нарушений. Эта дискриминация может быть связана с заболеваниями, передаваемыми в семье, до психических расстройств, с которыми человек не может помочь.

Неприкосновенность частной жизни и конфиденциальность генетической информации также может привести к проблемам. По определенным причинам многие люди хотели бы, чтобы никто не видел их генетический состав. Также могут возникнуть проблемы психологического характера, связанные со знанием своей собственной генетической структуры. Если бы кто-то узнал, что у него есть хорошие шансы заболеть редкой болезнью, это, скорее всего, радикально изменило бы его образ жизни. Что касается воспроизводства, могут возникнуть проблемы совместимости двух человек с нормальными детьми.Это вызовет стресс в жизни большого количества людей.

Другой возникший вопрос — это использование генной терапии для лечения болезней. Использование генома человека, чтобы определить, является ли человек генетическим заболеванием, поможет в лечении этих заболеваний. В генной терапии дефектный или инфицированный ген заменяется нормальным геном, поэтому человек не проявляет черту, с которой он родился от природы. Многие люди считают, что это неправильно, потому что мы в большей или меньшей степени подчиняемся природе, и считают, что это неестественный путь.

Есть также клинические проблемы, которые необходимо контролировать с помощью HGP. Когда проект будет завершен, наших работников здравоохранения нужно будет обучить многим новым методам. Также необходимо будет информировать пациентов и широкую общественность о том, что происходит в этих процедурах. Людям, проходящим генетическое тестирование, потребуется генетическое консультирование. Поставщикам медицинских услуг необходимо знать, как рассказать людям о последствиях, связанных с тестированием, которое они будут проходить.

HGP также вызовет опасения по поводу коммерциализации технологии. Если над проектом работают всего несколько агентств, кто получит права на технологию. Основная проблема, скорее всего, будет связана с патентами и авторскими правами на технологию.

Есть также критики HGP, которые утверждают, что высокая стоимость проекта неоправданна. Некоторые критики также говорят, что возможность диагностировать генетическое заболевание до того, как будет доступно какое-либо лечение, приносит больше вреда, чем пользы, поскольку вызывает беспокойство и разочарование среди людей (2).Еще очень большой вопрос, что такое «нормально». Когда и где использование генетического материала можно будет использовать в обществе после завершения HGP.

Мои чувства по теме

Я верю, что проект «Геном человека» внесет большой вклад в нашу повседневную жизнь, поскольку мы вступаем в 21 век. Количество, которое он может повлиять на нашу жизнь, безгранично. Я думаю, что проект принесет много положительных результатов, но я также чувствую, что есть ряд вещей, которые могут навредить нашему обществу в целом.В целом, я считаю, что положительные эффекты намного перевешивают отрицательные эффекты, которые может оказать нам HGP.

Я верю, что проект в будущем сильно изменит способ оказания медицинской помощи. Эффект должен помочь уменьшить часть травм и страданий, которые происходят в современном обществе от генетических заболеваний. Я также считаю, что необходимо контролировать использование этой информации, чтобы вылечить или предотвратить заболевание человека, которое причиняет ему боль.Я не совсем уверен, где и как этот мониторинг должен быть реализован или как он будет работать, но должны быть некоторые рекомендации.

Что касается вопроса конфиденциальности и справедливости использования генетической информации, я считаю, что человек должен иметь право знать, находится ли он в опасности заразиться. С другой стороны, я не думаю, что для таких агентств, как страховые компании, работодатели или школы, следует предоставлять личную информацию, чтобы они могли принимать дискриминационные решения на основе генома человека.Этот конкретный человек, скорее всего, не может изменить свои гены, поэтому его не следует подвергать дискриминации.

Что касается вопроса о том, кто получает прибыль от проекта, я считаю, что мы, как налогоплательщики, должны получать информацию на каком-то общедоступном носителе. Поскольку Министерство энергетики и Национальные институты здравоохранения финансируются правительством США, мы фактически оплачиваем большую часть счетов как налогоплательщики.

Я думаю, что это должен быть выбор человека, хочет ли он или она манипулировать определенным геном, чтобы у них не было определенного заболевания.Родители, ожидающие ребенка, также должны иметь право видеть, будет ли у них здоровый маленький ребенок. Когда ребенок развивается, я также чувствую, что у родителей должен быть выбор, чтобы увидеть, есть ли какие-либо врожденные дефекты или другие аномалии плода, которые могут привести ребенка к несчастной жизни.

Технология не обязательно должна использоваться для личной выгоды. Если бы мы смогли это сделать, то дошли бы до того, что люди стали бы более или менее клонами друг друга.Вот где должно быть введено какое-то регулирование. Я не уверен, что это можно полностью остановить. Всегда найдется кто-то, кто предложит свои услуги, чтобы помочь другому человеку за нужную сумму денег.

Я считаю, что использование генной инженерии очень полезно для перспективного использования в сельском хозяйстве и животноводстве. Технологии, которые появятся в будущем, будут очень полезны нам как обществу. Использование этой информации может помочь нам вылечить многие болезни животных и уменьшить ущерб, наносимый нашим посевам ежегодно насекомыми и болезнями.Таким образом, мы могли бы производить больше для потребителя с меньшими затратами.

Список литературы
1. Информация о проекте «Геном человека». Получено из WWW 10/19/99: 10/11/99: http://www.ornl.gov/hgmis/.
2. Проект «Геном человека». Получено из WWW 10/19/99: 1992: http://www.accessexcellence.org/.
3. Проект «Геном человека». Получено из WWW 10/19/99: 1/5/99: http://www.nhgri.nih.gov/.
4. Маршалл, Эллиот. Новые цели проекта генома человека в США: 1998-2003 гг.Наука. Vol. 282. Pg.682-688. 23 октября 1998 г.
5. Маршалл, Эллиот. Чей это вообще геном? Наука. Том 273. стр 1788-1789. 27 сентября 1996 г.
6. Маршалл, Эллиот. Коммерческие фирмы выигрывают фонды секвенирования в США. Наука. Vol. 285 стр. 310. 16 июля 1999 г.

Список сочинений учащихся

Домашняя страница курса

Генетические услуги

В области генетики происходит много интересных событий. Одним из последних является международная попытка создать карту всей ДНК человека (также называемой геномом).Вот некоторая информация, которая поможет вам понять, что происходит с проектом «Геном человека» (HGP).

Содержание

Что такое HGP?
Как HGP может повлиять на меня?
Кто отвечает за HGP?
Где я могу получить дополнительную информацию?

Что такое HGP?

HGP — это масштабное исследование, в котором участвуют организации со всего мира. Возможно, это самый важный проект в области биологии и медицины.Это то, что навсегда изменит наш взгляд на жизнь. С помощью этого исследования ученые пытаются идентифицировать весь генетический материал (ДНК), содержащийся в каждой из наших клеток (геном). Они пытаются выяснить, какие черты представляют каждый фрагмент ДНК (гена). Для этого проекта Министерство энергетики США и Национальные институты здравоохранения (NIH) поставили пять основных целей:

  • Для разработки инструментов, необходимых для анализа данных
  • Для идентификации всех генов в ДНК человека (по оценкам, 80 000–100 000)
  • Чтобы определить, где эти гены расположены в ДНК
  • Для решения этических, юридических и социальных проблем, которые могут возникнуть в результате изучения этой информации
  • Для хранения этой информации в базах данных для будущего использования

Как HGP может повлиять на меня?

Исследователи, работающие над HGP, утверждают, что он может влиять на многие аспекты жизни.Изучая ДНК, мы можем решить множество задач, стоящих перед здравоохранением, источниками энергии, сельским хозяйством и очисткой окружающей среды. Этот проект также может помочь человечеству следующими способами:

  • Сделайте диагностику заболеваний более быстрой и надежной
  • Разрешить создание новых, более эффективных лекарств
  • Разработать «генную терапию», при которой дефектные гены можно заменить здоровыми
  • Привести к лучшему лечению инфекционных заболеваний за счет лучшего понимания микробов.
  • Помогите семьям предсказать и решить потенциальные проблемы с новорожденными.
  • Создайте устойчивые к болезням растения, которые улучшат экономику сельского хозяйства.

Кто отвечает за HGP?

Министерство энергетики США и Национальные институты здравоохранения (NIH) запустили HGP в США в 1990 году. Многие лаборатории в США получают финансирование от одного или обоих этих агентств для исследований в рамках проекта «Геном человека». Колледжи, университеты и частные компании со всего мира работают вместе для достижения целей HGP.Дополнительная информация.

Где я могу получить дополнительную информацию?

Информация о проекте «Геном человека»

Спонсором этого сайта является Министерство энергетики США. Он предоставляет ценную информацию о текущих тенденциях в исследованиях генома человека. Он описывает цель и статус проекта на данный момент.

Национальный исследовательский институт генома человека

Спонсировано NIH и подробно описывает роль, которую NIH играет в HGP. Он содержит ссылки на несколько офисов NIH, занимающихся исследованиями генома человека.

Глоссарий генома

Содержит определения терминов, используемых при обмене информацией о HGP.

Генетика человека в Интернете

Содержит ссылки на сайты, которые предоставляют подробную информацию о HGP

.

Внешние ссылки на другие сайты предназначены для информационных целей и не получили одобрения Департамента здравоохранения штата Техас. Эти сайты могут быть недоступны для людей с ограниченными возможностями.

Проект «Геном человека»: большая наука меняет биологию и медицину | Genome Medicine

  • 1.

    Hood L: Примечания к присуждению премии Фрица Дж. И Долорес Х. Русс. Мост. 2011, 41: 46-49.

    Google Scholar

  • 2.

    Коллинз Ф.С., МакКусик В.А.: Последствия проекта «Геном человека» для медицины. ДЖАМА. 2001, 285: 540-544. 10.1001 / jama.285.5.540.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 3.

    Green ED, Guyer MS, Национальный исследовательский институт генома человека: Схема курса геномной медицины от основания до постели больного. Природа. 2011, 470: 204-213. 10.1038 / природа09764.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 4.

    Дульбекко Р: Поворотный момент в исследовании рака: секвенирование генома человека. Наука. 1984, 231: 1055-1056.

    Артикул Google Scholar

  • 5.

    Sinsheimer RL: Мастерская Санта-Крус — май 1985 г. Геномика. 1989, 5: 954-956. 10.1016 / 0888-7543 (89)

  • -0.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 6.

    Кук-Деган Р.М.: Генные войны: наука, политика и геном человека. 1994, Нью-Йорк: WW Norton

    Google Scholar

  • 7.

    Отчет об инициативе по геному человека для Управления исследований в области здравоохранения и окружающей среды.http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/project/herac2.shtml,

  • 8.

    Национальная академия наук: отчет комитета по картированию и секвенированию генома человека. 1988, Вашингтон, округ Колумбия: National Academy Press

    Google Scholar

  • 9.

    Консорциум по секвенированию генома человека: Завершение эухроматической последовательности генома человека. Природа. 2004, 431: 931-945. 10.1038 / природа03001.

    Артикул Google Scholar

  • 10.

    Понимание нашего генетического наследия. Проект генома человека США, Первые пять лет: финансовые годы. 1991, http://www.genome.gov/10001477, –1995,

  • 11.

    Коллинз Ф.С., Галас Д. Новый пятилетний план для Программы генома человека США. Наука. 1993, 262: 43-46. 10.1126 / science.8211127.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 12.

    Smith LM, Sanders JZ, Kaiser RJ, Hughes P, Dodd C, Connell CR, Heiner C, Kent SBH, Hood LE: обнаружение флуоресценции в автоматическом анализе последовательности ДНК.Природа. 1986, 321: 674-679. 10.1038 / 321674a0.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 13.

    Черч Г., Киффер-Хиггинс С. Мультиплексное секвенирование ДНК. Наука. 1988, 240: 185-188. 10.1126 / science.3353714.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 14.

    Strezoska Z, Paunesku T, Radosavljević D, Labat I, Drmanac R, Crkvenjakov R: Секвенирование ДНК путем гибридизации: 100 оснований считываются негелевым методом.Proc Natl Acad Sci USA. 1991, 88: 10089-10093. 10.1073 / пнас.88.22.10089.

    PubMed Central CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 15.

    Вентер Дж. К., Адамс М. Д., Саттон Г. Г., Керлаваж А. Р., Смит Х.о., Хункапиллер М.: Секвенирование генома человека с помощью дробовика. Наука. 1998, 280: 1540-1542. 10.1126 / science.280.5369.1540.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 16.

    Международный консорциум по секвенированию генома человека: первоначальное секвенирование и анализ генома человека. Природа. 2001, 409: 860-921. 10.1038 / 35057062.

    Артикул Google Scholar

  • 17.

    Вентер Дж. К., Адамс, доктор медицины, Майерс Э. У., Ли П. У., Фреска Р. Дж., Саттон Г. Г., Смит Х. О., Янделл М., Эванс, Калифорния, Холт Р. А., Гокейн Дж. Д., Аманатидес П., Баллью Р.М., Хусон Д.Х., Вортман-младший. , Zhang Q, Kodira CD, Zheng XH, Chen L, Skupski M, Subramanian G, Thomas PD, Zhang J, Miklos GLG, Nelson C, Broder S, Clark AG, Nadeau J, McKusick VA, Zinder N и др .: The последовательность генома человека.Наука. 2001, 291: 1304-1351. 10.1126 / science.1058040.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 18.

    Международный консорциум по секвенированию генома человека. http://www.genome.gov/11006939,

  • 19.

    Shendure J, Aiden ER: Расширяющиеся возможности секвенирования ДНК. Nat Biotechnol. 2012, 30: 1084-1094. 10.1038 / nbt.2421.

    PubMed Central CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 20.

    Hood L: личное путешествие к открытиям: развитие технологий и изменение биологии. Annu Rev Anal Chem. 2008, 1: 1-43. 10.1146 / annurev.anchem.1.031207.113113.

    CAS Статья Google Scholar

  • 21.

    Комитет по новой биологии для 21 века: новая биология для 21 века. 2009, Вашингтон, округ Колумбия: The National Academies Press

    Google Scholar

  • 22.

    Идекер Т., Галицкий Т., Худ Л.: Новый подход к расшифровке жизни: системная биология. Анну Рев Геномикс Хум Генет. 2001, 2: 343-372. 10.1146 / annurev.genom.2.1.343.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 23.

    Энциклопедия элементов ДНК. http://encodeproject.org/ENCODE/,

  • 24.

    Консорциум проекта ENCODE: интегрированная энциклопедия элементов ДНК в геноме человека. Природа. 2012, 489: 57-74.10.1038 / природа11247.

    Артикул Google Scholar

  • 25.

    От редакции: Форма и функции. Природа. 2013, 495: 141-142.

  • 26.

    Консорциум проектов ENCODE: Руководство пользователя Энциклопедии элементов ДНК (ENCODE). PLoS Biol. 2011, 9: e1001046-10.1371 / journal.pbio.1001046.

    Артикул Google Scholar

  • 27.

    Aebersold R, Mann M: протеомика на основе масс-спектрометрии.Природа. 2003, 422: 198-207. 10.1038 / природа01511.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 28.

    Пикотти П., Эберсолд Р.: Избранные протеомики, основанные на мониторинге реакций: рабочие процессы, потенциал, подводные камни и направления на будущее. Нат методы. 2012, 9: 555-566. 10.1038 / nmeth.2015.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 29.

    Desiere F, Deutsch EW, King NL, Несвижский AI, Маллик P, Eng J, Chen S, Eddes J, Loevenich SN, Aebersold R: The PeptideAtlas Project.Nucleic Acids Res. 2006, 34: D655-D658. 10.1093 / нар / gkj040.

    PubMed Central CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 30.

    Deutsch ED, Mendoza L, Shteynberg D, Farrah T, Lam H, Tasman N, Sun Z, Nilsson E, Pratt B, Prazen B, Eng JK, Martin DB, Nesvizhskii A, Aebersold R: A guided тур по Транс-протеомному трубопроводу. Протеомика. 2010, 10: 1150-1159. 10.1002 / pmic.2005.

    PubMed Central CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 31.

    Genomes Online Database: полные проекты генома. http://www.genomesonline.org/cgi-bin/GOLD/index.cgi?page_requested=Complete+Genome+Projects,

  • 32.

    Теобальд DL: формальный тест теории универсального общего предка. Природа. 2010, 465: 219-222. 10.1038 / природа09014.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 33.

    Вулф К.Э., Ли В.Х .: Молекулярная эволюция встречается с эволюцией геномики. Нат Жене.2003, Дополнение 33: 255-265.

    Артикул Google Scholar

  • 34.

    Marques-Bonet T, Ryder OA, Eichler EE: Секвенирование геномов приматов: что мы узнали ?. Анну Рев Геномикс Хум Генет. 2009, 10: 355-386. 10.1146 / annurev.genom.9.081307.164420.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 35.

    Нунан Дж. П.: Геномика неандертальцев и эволюция современного человека.Genome Res. 2010, 20: 547-553. 10.1101 / гр.076000.108.

    PubMed Central CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 36.

    Стоункинг М., Краузе Дж .: Изучение истории человеческой популяции на основе древних и современных геномов. Nat Rev Genet. 2011, 12: 603-614.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 37.

    Санкарараман С., Паттерсон Н., Ли Х., Паабо С., Райх Д.: Дата скрещивания неандертальцев и современных людей.PLoS Genet. 2012, 8: e1002947-10.1371 / journal.pgen.1002947.

    PubMed Central CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 38.

    Schatz MC: Вычислительное мышление в эпоху биологии больших данных. Genome Biol. 2012, 13: 177-10.1186 / GB-2012-13-11-177.

    PubMed Central Статья PubMed Google Scholar

  • 39.

    Mizrachi I: GenBank: База данных нуклеотидных последовательностей.Справочник NCBI. Отредактировано: Макэнтайром Дж., Остеллом Дж. 2002 г., Bethesda: Национальный центр биотехнологической информации

    Google Scholar

  • 40.

    Кент В.Дж., Сугнет К.В., Фьюри Т.С., Роскин К.М., Прингл Т.Х., Захлер А.М., Хаусслер Д.: Обозреватель генома человека в UCSC. Genome Res. 2002, 12: 996-1006.

    PubMed Central CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 41.

    SourceForge.http://sourceforge.net/,

  • 42.

    Bioconductor: программное обеспечение с открытым исходным кодом для биоинформатики. http://www.bioconductor.org/,

  • 43.

    Field D, Sansone SA, Collina A, Booth T, Dukes P, Gregurick SK, Kennedy K, Kolar P, Kolker E, Maxon M, Millard S, Мугабушака М., Перрин Н., Ремакл Дж. Э., Ремингтон К., Рокка-Серра П., Тейлор К. Ф., Торли М., Тивари Б., Уилбанкс Дж.: Обмен данными Omics. Наука. 2009, 326: 234-236. 10.1126 / science.1180598.

    PubMed Central CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 44.

    Кнопперс Б.М., Харрис Дж. Р., Тассе А. М., Будин-Лйосне И., Кей Дж., Дешенес М., Завати М.: На пути к Кодексу поведения при обмене данными для международных геномных исследований. Genome Med. 2011, 3: 46-10.1186 / gm262.

    PubMed Central Статья PubMed Google Scholar

  • 45.

    Худ L: Биологическая сложность под угрозой: личный взгляд на системную биологию и приход «большой науки». Genet Eng Biotechnol News. 2011, 31: 17-

    Статья Google Scholar

  • 46.

    Tripp S, Grueber M: Экономическое влияние проекта генома человека. 2011, Колумбус: Мемориальный институт Баттель

    Google Scholar

  • 47.

    Международный консорциум HapMap: карта гаплотипов генома человека. Природа. 2005, 437: 1299-1320. 10.1038 / природа04226.

    Артикул Google Scholar

  • 48.

    Международный консорциум HapMap3: объединение общих и редких генетических вариаций в различных человеческих популяциях.Природа. 2010, 467: 52-58. 10.1038 / природа09298.

    Артикул Google Scholar

  • 49.

    Эбботт A: Неврология: решение мозга. Природа. 2013, 499: 272-274. 10.1038 / 499272a.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 50.

    Консорциум проекта «1000 геномов»: интегрированная карта генетических вариаций из 1092 геномов человека. Природа. 2012, 491: 56-65.10.1038 / природа11632.

    PubMed Central Статья Google Scholar

  • 51.

    Каталог опубликованных полногеномных ассоциативных исследований. http://www.genome.gov/gwastudies/,

  • 52.

    Roach JC, Glusman G, Smit AF, Huff CD, Hubley R, Shannon PT, Rowen L, Pant KP, Goodman N, Bamshad M, Shendure J, Drmanac R, Jorde LB, Hood L, Galas DJ: Анализ генетической наследственности в семейном квартете путем секвенирования всего генома.Наука. 2010, 328: 636-639. 10.1126 / science.1186802.

    PubMed Central CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 53.

    Леви С., Саттон Дж., Нг ПК, Феук Л., Халперн А.Л., Валенц Б.П., Аксельрод Н., Хуанг Дж., Киркнесс Е.Ф., Денисов Г., Лин И, Макдональд Дж. Р., Панг А. В., Шаго М., Стоквелл ТБ , Циамури А., Бафна В., Бансал В., Кравиц С.А., Бусам Д.А., Бисон К.Ю., Макинтош Т.С., Ремингтон К.А., Абрил Дж. Ф., Гилл Дж., Борман Дж., Роджерс Ю. Х., Фрейзер М. Е., Шерер С. В., Штраусберг Р. Л. и др. диплоидная последовательность генома отдельного человека.PLoS Biol. 2007, 5: e254-10.1371 / journal.pbio.0050254.

    PubMed Central Статья PubMed Google Scholar

  • 54.

    Уиллер Д.А., Сринивасиан М., Эгхолм М., Шен Й, Чен Л., МакГуайр А., Хе В., Чен Ю.Дж., Махиджани В., Рот Г.Т., Гомес Х, Тартаро К., Ниази Ф., Тюркотт К.Л., Ирзик Г.П. , Lupski JR, Chinault C, Song X, Liu Y, Yuan Y, Nazareth L, Qin X, Muzny DM, Margulies M, Weinstock GM, Gibbs RA, Rothberg JM: Полный геном человека путем массового параллельного секвенирования ДНК.Природа. 2008, 452: 872-876. 10.1038 / природа06884.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 55.

    International Cancer Genome Consortium. http://icgc.org/,

  • 56.

    Атлас генома рака. http://cancergenome.nih.gov/,

  • 57.

    Pandey A: Подготовка к пациенту 21 годов века. ДЖАМА. 2013, 309: 1471-1472. 10.1001 / jama.2012.116971.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 58.

    Худ Л., Флорес М.: Личный взгляд на системную медицину и появление проактивной медицины P4: прогнозирующей, превентивной, персонализированной и совместной. Nat Biotechnol. 2012, 29: 613-624.

    CAS Google Scholar

  • 59.

    Прайс Н.Д., Эдельман Л. Б., Ли И., Ю Х, Хван Д., Карлсон Дж., Галас Д. Д., Хит Дж. Р., Худ Л.: Системная биология и появление системной медицины. Геномная и персонализированная медицина: от принципов к практике.Том 1. Под редакцией: Ginsburg G, Willard H. 2009, Philadelphia: Elsevier, 131–141.

    Google Scholar

  • 60.

    Green RC, Berg JS, Grody WW, Kalia SS, Korf BR, Martin CL, McGuire A, Nussbaum RL, O’Daniel JM, Ormond KE, Rehm HL, Watson MS, Williams MS, Biesecker LG: Рекомендации ACMG по сообщению о случайных результатах клинического экзома и секвенирования генома. 2013, Bethesda: Американский колледж медицинской генетики и геномики

    Google Scholar

  • 61.

    Мейерсон М., Габриэль С., Гетц Г.: достижения в понимании геномов рака с помощью секвенирования второго поколения. Nat Rev Genet. 2010, 11: 685-696. 10.1038 / nrg2841.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 62.

    Qin S, Zhou Y, Lok AS, Tsodikov A, Yan X, Gray L, Yuan M, Moritz RL, Galas D, Omenn GS, Hood L: нацеленная протеомика SRM в поисках биомаркеров HCV-индуцированного прогрессирование фиброза в цирроз печени у пациентов с HALT-C.Протеомика. 2012, 12: 1244-1252. 10.1002 / pmic.201100601.

    PubMed Central CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 63.

    Li XJ, Hayward C, Fong PY, Dominguez M, Hunsucker SW, Lee LW, McClean M, Law S, Butler H, Schirm M, Gingras O, Lamontague J, Allard R, Chelsky D, Price ND , Lam S, Massion PP, Pass H, Rom WN, Vachani A, Fang KC, Hood L, Kearney P: протеомный классификатор на основе крови для молекулярной характеристики легочных узелков.Sci Transl Med. в печати

  • 64.

    Кнопперс Б.М., Торогуд А., Чедвик Р.: Организация генома человека: к этике следующего поколения. Genome Med. 2013, 5: 38-10.1186 / GM442.

    PubMed Central Статья PubMed Google Scholar

  • 65.

    Hood L: Кто мы: книга жизни. Начальный адрес. Журнал Whitman College. 2002, 4-7.

    Google Scholar

  • 66.

    Фостер М.В., Шарп Р.Р .: Вне расы: к полногеномному взгляду на человеческие популяции и генетические вариации. Nat Rev Genet. 2004, 5: 790-796. 10.1038 / nrg1452.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 67.

    Royal CDM, Dunston GM: изменение парадигмы с «расы» на генетические вариации человека. Нат Жене. 2004, 36: S5-S7. 10.1038 / ng1454.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 68.

    Уизерспун Д. Д., Вудинг С., Роджерс А. Р., Марчани Э., Уоткинс В. С., Батцер М. А., Джорд Л. Б.: Генетические сходства внутри и между популяциями. Генетика. 2007, 176: 351-359. 10.1534 / genetics.106.067355.

    PubMed Central CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 69.

    Genovese G, Handsaker RE, Li H, Altemose N, Lindgren AM, Chambert K, Pasaniuk B., Price AL, Reich D, Morton CC, Pollak MR, Wilson JG, McCarroll SA: Использование примеси населения для помощи полные карты генома человека.Нат Жене. 2013, 45: 406-414. 10.1038 / нг.2565.

    PubMed Central CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 70.

    Fernandez-Suarez XM, Galperin MY: The, Nucleic Acids Research Database Issue и онлайн-сборник баз данных по молекулярной биологии. Nucleic Acids Res. 2013, 2013: D1-D7.

    Артикул Google Scholar

  • 71.

    Human Proteome Project.http://www.hupo.org/research/hpp/,

  • 72.

    Hood LE, Omenn GS, Moritz RL, Aebersold R, Yamamoto KR, Amos M, Hunter-Cevera J, Locascio L, участники семинара: Новые и улучшенные технологии протеомики для понимания сложных биологических систем: решение серьезной проблемы наук о жизни. Протеомика. 2012, 12: 2773-2783. 10.1002 / pmic.201270086.

    PubMed Central CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 73.

    От редакции: Зов протеома человека. Нат методы. 2010, 7: 661-

  • 74.

    Schadt E, Turner S, Kasarskis A: Окно в секвенирование третьего поколения. Hum Mol Genet. 2010, 19: R227-R240. 10.1093 / hmg / ddq416.

    CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 75.

    Ким Дж. К., Самаранаяке М., Прадхан С.: Эпигенетические механизмы у млекопитающих. Cell Mol Life Sci. 2009, 66: 596-612. 10.1007 / s00018-008-8432-4.

    PubMed Central CAS Статья PubMed Google Scholar

  • 76.

    Hon G, Ren B, Wang W: ChromaSig: вероятностный подход к поиску общих сигнатур хроматина в геноме человека. PLoS Comput Biol. 2008, 4: e1000201-10.1371 / journal.pcbi.1000201.

    PubMed Central Статья PubMed Google Scholar

  • 77.

    Hayden EC: Дебют секвенатора генома нанопор.Новости природы. 2012, -10.1038 / природа.2012.10051.

    Google Scholar

  • Медицинские и социальные последствия проекта «Геном человека»

    В 1988 г. Конгресс выделил средства Министерству энергетики (DOE) и Национальным институтам здравоохранения (NIH) для начала планирования проекта «Геном человека». Планировщики установили 15-летний срок, оценили цену в 3 миллиарда долларов и поставили формальные цели для выполнения работы. 1 1 октября 1990 г. официально стартовал проект «Геном человека». 2 Согласно ранним планам, человечество станет свидетелем своего собственного детального плана в 2005 году.

    Однако осенью 1998 года появляются улучшения в технологиях, успех в достижении целей раннего картирования (см. Ниже). Возможности исследований и растущий спрос на последовательность ДНК человека побудили руководителей проектов в Соединенных Штатах и ​​за рубежом пообещать план — полную последовательность ДНК человеческого генома — на два года раньше запланированного срока, в 2003 году. 3 Технология для решения такой задачи уже под рукой. Действительно, всего шесть месяцев спустя, в марте 1999 года, 15 процентов эпизода находились в завершенном или почти завершенном состоянии. Крупнейшие центры, участвующие в проекте «Геном человека», получили новые гранты на начало полномасштабного секвенирования генома человека, и график был снова перенесен. Пилотные проекты по секвенированию оказались настолько успешными, что разработчики проекта «Геном человека» теперь были уверены, что по крайней мере 90 процентов последовательности операций человека могут быть завершены в виде «рабочего проекта» к весне 2000 года, что значительно раньше, чем ожидалось.

    Ожидается, что программы генома NIH и DOE внесут от 60 до 70 процентов последовательности. Остальную часть произведут ученые, финансируемые Wellcome Trust в Центре Сэнгера в Кембридже, Англия, вместе с другими международными партнерами.

    Пока не будет завершена полная последовательность человеческого генома, в 2003 году или, возможно, раньше, рабочая последовательность будет очень полезна, особенно для поиска генов, экзонов и других геномных особенностей. Но поскольку рабочий черновик будет содержать пробелы и не будет полностью точным, он будет не так полезен, как готовая последовательность, для изучения особенностей ДНК, охватывающих большие области или требующих высокой степени точности на длинных участках последовательности.

    Конечный продукт должен иметь четыре характеристики — четыре «А» проекта «Геном человека». Во-первых, последовательность должна быть с точностью до — то есть написание ДНК должно иметь точность 99,99 процента или выше. Если это Книга Жизни, мы не должны довольствоваться черновым наброском в долгосрочной перспективе, но должны оставаться приверженными созданию окончательной, очень точной версии. Во-вторых, крупномасштабное секвенирование требует, чтобы более короткие отрезки секвенированной ДНК были точно собраны в более длинные части геномного масштаба, которые отражают исходную геномную ДНК.В-третьих, последовательность ДНК человека должна быть доступной , и развитие технологий будет направлено на максимальное снижение стоимости. Наконец, высококачественная законченная последовательность ДНК человека должна быть доступна в течение 24 часов через общедоступные базы данных.

    Что касается последнего пункта, совершенно необходимо, чтобы последовательность генома, фундаментальный строительный блок биомедицинских исследований, была быстро и бесплатно доступна для ученых всего мира. Последовательность ДНК человека вооружает ученых, стремящихся понять болезнь, новой информацией и методами, позволяющими разгадывать загадки человеческой биологии.Эти знания значительно ускорят разработку новых стратегий диагностики, профилактики и лечения заболеваний, не только для расстройств, связанных с одним геном, но и для более распространенных сложных заболеваний (например, диабета, сердечных заболеваний, шизофрении и рака). для которых генетические различия могут способствовать риску заражения болезнью и ответу на определенные методы лечения.

    В 1996 году на втором международном совещании по стратегии секвенирования генома человека группа ученых, занимающихся крупномасштабным секвенированием геномной ДНК, приняла единодушное решение о том, что все данные о последовательностях, полученные в рамках проекта «Геном человека», должны быть в свободном доступе и в открытом доступе. домена, чтобы поощрять исследования и разработки и приносить максимальную пользу обществу.Эти ученые считали, что общедоступность этих данных будет способствовать координации и сотрудничеству между учеными, предотвращая дублирование усилий.

    В результате планировщики проекта «Геном человека» приняли политику публикации данных каждые 24 часа в бесплатной общедоступной базе данных. В Соединенных Штатах GenBank (доступный по адресу http: // www. Ncbi.nlm.nih.gov), управляемый Национальным центром биотехнологической информации, служит публичным хранилищем информации о последовательностях.Ценность этой базы данных как ресурса для ученых-медиков по всему миру не поддается оценке. GenBank получает более 200 000 запросов в день для получения информации о последовательностях генов. На включение первого миллиарда баз в базу данных ушло 16 лет, а на добавление второго миллиарда баз — всего 15 месяцев. Представлено более 39 000 видов, и ежедневно проводится более 60 000 поисков для сравнения последовательностей.

    Поскольку исследователи всего мира, участвующие в общественной работе по секвенированию, согласились предоставить свои данные в бесплатные общедоступные базы данных в течение одного дня после проверки, любой ученый, работающий в университете, корпорации или правительственной лаборатории, может регистрировать на компьютере и иметь полный и быстрый доступ к данным последовательности.Чем раньше будут завершены финансируемые государством усилия по секвенированию генома человека и данные будут помещены в бесплатную и общедоступную базу данных, тем скорее это принесет пользу всем ученым, работающим над пониманием и лечением болезней на молекулярном уровне. Кроме того, ученые понимают гены человека, сравнивая ДНК человека с ДНК мышей, мух, круглых червей и дрожжей. Эти сравнения значительно упрощают понимание человеческой последовательности.

    Пока разрабатывались планы Проекта генома человека на период между 1998 и 2003 годами, два корпоративных предприятия объявили об инициативах по секвенированию основной части генома человека с использованием стратегий, которые в корне отличаются от подхода, финансируемого государством.Заявленное намерение одного из этих предприятий обнародовать свои данные создает возможность синергии с федеральными усилиями. Если корпоративные данные и общедоступные данные могут быть объединены, глубина охвата последовательности будет еще больше. А поскольку общедоступные данные о последовательностях будут получены из картированной ДНК, они обеспечат критически необходимую привязку к данным о последовательностях, созданным усилиями частного сектора.

    Проект генома человека в ретроспективе 2020 г.

    Действительно, благодаря HGP были катапультированы целые поля.«[HGP] является основным достижением, лежащим в основе того, что было достигнуто в области исследований в области генной терапии, и того, над чем мы продолжаем работать», — отмечает Федерико Мингоцци, доктор философии, главный научный сотрудник Spark Therapeutics. HGP, продолжает он, «предоставил дорожную карту генетической информации, необходимой для предоставления пациентам первой генной терапии генетического заболевания [Luxturna] в Соединенных Штатах».

    Вклад в другие области, такие как синтетическая биология, может быть менее очевиден, но не менее важен.Кейт Робисон, доктор философии, давний блоггер по геномике на сайте omicsomics.blogspot.com, говорит GEN , что в области синтетической биологии «распространение технологий из HGP означает, что у нас есть инструменты как для исследования биологического мира, так и для его изучения. использовать секвенирование для проверки наших проектов и в качестве считывания ».

    Появление геномной медицины

    Одна отрасль, которая не могла бы существовать без HGP, — это личная генетика. Эрик Грин, доктор медицинских наук, преемник Коллинза на посту директора NHGRI, говорит GEN , что он «не ожидал, что геномная медицина станет реальностью в течение моей карьеры, возможно, даже при моей жизни.Но он отмечает, что одним из достижений HGP является «первоначальное осознание значимого применения геномики в медицинской практике во время активной карьеры тех, кто работал на передовой HGP, а не намного позже этих людей». карьера была закончена ».

    В 2012 году ученые из Университета Лестера решили распечатать полную версию генома человека. Когда они были закончены, у них был 130-томный памятник сущности человечества — казалось бы, бесконечная последовательность четырех пунктов: «А», «Т», «С» и «G».Любопытно, что затраты на проект печати уже превысили затраты на фактическое секвенирование генома заново. С тех пор разница в цене только выросла.

    Робисон указывает на гиперперсонализированные методы лечения редких заболеваний и перспективы «положить конец диагностическим одиссеям» для детей с заболеваниями, которые были диагностированы с помощью полногеномного или полногеномного секвенирования. Совсем недавно были замечены захватывающие случаи, когда лекарства были перепрофилированы для отдельных пациентов или сделаны трансплантаты — например, новаторская история олигонуклеотидной терапии, разработанной для одного конкретного пациента с редким, фатальным нейродегенеративным состоянием, о которой сообщалось в прошлом году в New England Медицинский журнал группы, возглавляемой Тимоти Ю, доктором медицины, доцентом педиатрии Гарвардской медицинской школы.

    Дина Черч, доктор философии, старший директор по приложениям для млекопитающих в Inscripta, которая была одним из первых членов команды HGP, соглашается, что диагностика редких заболеваний представляет собой действительно значительный прогресс. Она также ставит диагностику рака на первое место в своем списке. Способность секвенировать геномы рака «изменила наше представление о раке и его лечении» — от сосредоточения внимания на месте происхождения до понимания того, что опухоли, обнаруженные в разных частях тела, могут возникать в результате одних и тех же мутаций. Осознание этого, добавляет она, предполагает, что опухоли, поражающие разные части тела, можно лечить с помощью одних и тех же лекарств.

    Многие руки делают легкий выбор, если спорят) работают

    HGP был «одним из крупнейших совместных научных экспериментов в мире», — отмечает Мингоцци. Развивая этот вопрос, Карлтон заявляет, что одним из постоянных вкладов HGP является «положительный прецедент для сотрудничества между государственными и частными организациями».

    Сборка генома была предпринята двумя конкурирующими группами — консорциумом под руководством правительства HGP и Celera Крейга Вентера — с использованием разных подходов и различных методов работы.Все это объединилось для совместного объявления в Белом доме и, восемь месяцев спустя, одновременной публикации в журналах Nature и Science .

    Фельзенфельд больше всего гордится тем, как он «собрал вместе действительно выдающихся ученых для работы над проектом, который был важным, но не мог быть реализован без сотрудничества». Эта модель большой биологии, утверждает Фельзенфельд, была воспроизведена «во многих консорциумах, преследующих сложные проекты». С этим связана этика «проекта ресурсов сообщества», заключающаяся в депонировании больших наборов данных перед публикацией, чтобы они могли использоваться сообществом.Это похвальный идеал, который сейчас является обязательным для крупных проектов, но требует много усилий для достижения.

    Примеру, установленному HGP, последовали многочисленные крупномасштабные геномные инвентаризации: Энциклопедия элементов ДНК выберите ENCODE union — общественное исследовательское усилие, которое выявило функциональные элементы в геномах человека и мыши; HapMap, международный проект по разработке карты гаплотипов; Проект «1000 геномов» — попытка создать наиболее подробный каталог генетических вариаций человека; и недавно созданный Международный альянс по общим заболеваниям, инициатива, которая носит девиз «Карты механизмов в медицину» и направлена ​​на использование генетики человека для понимания и лечения распространенных болезней.

    «Предстоит еще много тяжелой работы» ~ Президент Клинтон

    Успехи в области геномных исследований и медицины после празднования Белого дома не подлежат сомнению. Однако, как и ограничения эталонного генома. Основное ограничение нынешней ссылки связано со сложностью геномных вариаций в человеческих популяциях и тем, что Грин называет «проблемами захвата и представления бесчисленных возможных« версий »человеческого генома, встречающихся в нашем виде, — все относительно одной ссылки.«Разработка более надежных подходов для усвоения и визуализации этой вариации относительно эталонной последовательности представляет собой важную область исследований, — отмечает он.

    В прошлом году NHGRI объявил о выделении примерно 30 миллионов долларов на поддержку исследований с этой целью. Фонды поддерживают мультиинституциональные центры секвенирования, которые расширят текущий референсный геном человека с единственной линейной эталонной последовательности до коллекции различных геномов в попытке создать пангеном человека.Программа сравнения генома человека направлена ​​на секвенирование до 350 различных геномов человека для включения последовательностей, которые являются более широко репрезентативными.

    Некоторые ученые предпринимают шаги для увеличения количества геномного разнообразия, по одному эталонному геному за раз. Лаборатория Стивена Зальцберга, доктора философии, профессора биомедицинской инженерии, информатики и биостатистики в Медицинской школе Университета Джона Хопкинса (JHU) — соавтора оригинального исследования генома человека Celera — недавно сообщила о данных последовательности ДНК, отсутствующих в справочнике. геном.Анализ группы данных из 910 человек африканского происхождения показал, что в эталонном геноме отсутствует примерно 300 миллионов пар оснований — почти 10% всего эталонного генома.

    В недавнем препринте лаборатории Зальцберга описывается первая попытка создать альтернативный эталонный геном человека, основанный на глубоком секвенировании индивидуума ашкенази. В ходе работы был собран и аннотирован геном индивида ашкенази, и был создан новый эталонный геном человека, ориентированный на популяцию.

    Зальцберг сообщает GEN , что его группа воодушевлена ​​новым эталонным геномом и надеется использовать те же методы для создания других примеров. Он заявляет, что «комбинация очень длинных и коротких чтений, оба из которых очень глубоко секвенированы у одного человека, может дать действительно хороший эталонный геном». Он добавляет, что если вы также можете упорядочить родителей, «это может быть даже лучше».

    Наследие проекта «Геном человека»

    Проект «Геном человека» (HGP) был выдающимся научным и человеческим достижением — поистине великолепным подвигом фундаментальной науки.Для фундаментальной науки уроки и выводы многочисленны и включают ценность сотрудничества и обмена данными (упомянутые в статье). Кроме того, подход под руководством выдающихся ученых (таких как Филип Грин из Университета штата Вашингтон), направленный на максимальную точность, а не эффективность при разработке проекта генома человека.

    Уроки HGP для политики и программ следующие. не менее ясны, но остаются в основном без внимания. «Конечным обещанием HGP было улучшение жизни людей, переход от биологического понимания болезни к диагностике, лечению или даже профилактике.Эталонный геном уже начал оказывать такое влияние, особенно на редкие неонатальные заболевания и рак. «HGP обещал« раскрыть секреты человеческой жизни »и произвести революцию в медицине и нашем понимании здоровья и болезней человека.

    Спустя два десятилетия мы все еще ждем революции. У нас есть настоящий избыток генетических данных и более глубокое понимание генетических различий, а также регуляции генов, производства белков и взаимодействий. Но разрыв между человеческими различиями в последовательностях и профилактикой и лечением болезней остается огромным.Урок, который мы не усвоили, заключается в том, что нам следует прекратить давать обещания в области общественного здравоохранения, основанные на наивных надеждах и принятии желаемого за действительное, а не на доказательствах и разумных ожиданиях, потому что они становятся обещаниями, которые мы не можем выполнить.

    Майк Фортун 1 считает эту опору на постоянно возобновляемые и разрекламированные невыполненные обещания достижений в области общественного здравоохранения «долгосрочным режимом» генетики. Вопрос не в том, почему мы продолжаем возобновлять эти обещания, потому что это очевидно.Научные проекты требуют значительного финансирования, особенно крупномасштабные проекты, требующие значительных человеческих и других ресурсов, в том числе времени. Связывание таких проектов с социальными приложениями (с политикой и программами в области здравоохранения и социальной защиты) часто бывает полезным, если не необходимым, для получения энтузиазма и финансирования таких проектов. Тем не менее, эти обещания остаются в основном невыполненными и все более пустыми. Так не должно быть.

    Фундаментальная наука необходима. Мы не можем и часто не знаем заранее, повлияют ли научные исследования на общественное здоровье и как они это сделают.Часто это не так, но научные исследования, прокладывающие путь к будущему прогрессу за счет постепенного увеличения знаний и / или технологических усовершенствований, чрезвычайно ценны. Действительно, наука идет путем постепенных улучшений и исправлений. Нам не нужно и не следует требовать, чтобы ученые устанавливали неоправданные связи между фундаментальными исследованиями, политикой и практикой, когда пробелы слишком велики и / или база знаний неопределенная и незрелая.

    HGP выполнила свою фундаментальную науку. обещают секвенировать геном человека и создать эталонный геном.Другими обещаниями были выдвижение желаемого за действительное, наивная экстраполяция и совершенно ненужные и неуместные. Мы должны финансировать строгую фундаментальную науку и препятствовать усилиям по формированию научных исследований, преувеличивая их значимость для государственной политики или общественного здравоохранения.

    Мы должны судить о HGP по ее научным достижениям, а не по ее главным надеждам; отказаться от «долгового режима» и установить разумные научные ожидания, в которых фундаментальная наука ценится сама по себе.

    Небольшой пункт : Я спорю, что слово «гены» уместно в этом предложении. .«Как и предсказывала современная генетика, GWAS в основном находят гены с небольшой величиной эффекта, но это, тем не менее, важные ключи к разгадке причинных механизмов заболевания, которые в противном случае могут остаться недоступными». Несколько «совпадений» GWAS идентифицируют гены.

    1. Удача, Майкл. Многообещающая геномика: Исландия и deCODE Genetics в мире спекуляций . Беркли: Калифорнийский университет Press, 2008.

    .

    Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

    *